Azt követően, hogy a kéziratot a folyóirat szerkesztői áttekintették, és úgy ítélik meg az elsődleges vizsgálat alapján, hogy az érdemesnek bizonyulhat publikálásra, kezdetét veszi a peer review, vagyis a szakmai bírálat.
A szakmai lektorálás az a folyamat, amelynek során egy adott terület vagy tudományág szakértői értékelik egy másik kutató kutatásának minőségét, hogy felmérjék a publikálásra szánt cikkek érvényességét, minőségét és gyakran eredetiségét. Ez az alapja a tudományos kutatások minőségének és integritásának megőrzésének.

A peer review a következő előnyöket biztosítja
- Javítja a minőséget: Javítja a kutatás általános minőségét azáltal, hogy konstruktív visszajelzést és javaslatokat nyújt a szerzőknek javításra.
- Azonosítja a hibákat: A lektorok pontatlanságokat, módszertani problémákat és érvelési hiányosságokat azonosíthatnak.
- Elősegíti az együttműködést: A lektorálás elősegíti a kapcsolatokat a szerzők és a lektorok között, ami potenciálisan együttműködéshez és további kutatási lehetőségekhez vezethet.

A szakmai lektorálási folyamat nem tökéletes. A kritikusok kiemelik, hogy a szakmai lektorálás ellenére egyes cikkek továbbra is pontatlanságokat tartalmazhatnak. Ezek a kritikus megállapítások azért fontosak, mert a peer review egy emberi tevékenység, amely tökéletességre és hitelességre törekszik, azonban emberi vonatkozása miatt fennáll a hibák lehetősége.
A peer review típusai
A szerző nem ismeri a szakmai bírálót, azonban a bíráló ismeri a szerző személyazonosságát. Nem csak akkor, amikor arról dönt, hogy a cikk elfogadásra vagy elutasításra kerül, hanem a lektorálási folyamat teljes ideje alatt.
A folyóirat szerkesztője nem ad ki semmilyen információt a bírálónak a szerzőről, és fordítva. A személyazonosság tehát mindkét fél számára ismeretlen marad. Minden személyazonosságra utaló jelet (név, affiliáció) törölnek a bíráló elé tárt példányból.
A szerzők és a szakmai bírálók mind tisztában vannak egymás személyazonosságával. Az open peer review lehetővé teszi azt, hogy a bírálók megjegyzései és a szerzők válaszai megjelenjenek a cikk végleges, publikált verziójában.
A peer review ezen fajtája a folyóirat erre a célra készített platformján történik, ahol a szerzők és a bírálók együtt dolgoznak a közlemény tökéletesítésén. A bírálók kiléte gyakran rejtve marad a szerzők előtt egészen a publikálás dátumáig.
A kézirat szakmai bírálata még a folyóirathoz való beküldés előtt megtörténik. A bírálatot egy külső, erre specializálódott szolgáltató végzi el. A folyóirat a már javított változatot kapja meg.
A folyóirat egy fórumhoz hasonló felületet biztosít az olvasók számára, ahol a már megjelent közlemények véleményezhetők. A cikkhez megjelenés után bárki hozzászólhat.
Ha egy kéziratot elutasítanak egy folyóirattól – például azért, mert a cikk nem illik a folyóirat arculatához -, a szerkesztőség javaslatot tehet egy másik folyóirat választására, a véleményezésekkel együtt. A javasolt folyóirat gyakran része az eredeti kiadó folyóirat-portfóliójának.
Az átlátható lektorálásnak köszönhetően a lektorok jelentései, a szerzők válaszai és a szerkesztők döntései az elfogadott cikkek mellett kerülnek közzétételre.